Ingénieurs Vénitiens et artisans locaux
Les fortifications de Spinalonga représentent de brillants exemples du génie des ingénieurs Vénitiens, mais aussi du grand savoir-faire des artisans locaux. Malgré ses problèmes financiers, l'État vénitien fait preuve d’un grand intérêt et dépense des sommes particulièrement élevées pour la construction de ces fortifications. En effet, l’élément ayant contribué à leur préservation jusqu'à aujourd'hui, est l'excellente qualité de construction.
Le tracé et la construction de la forteresse furent confiées à l'ingénieur Genese Bressani. Les premiers travaux sont supervisés personnellement par le Provéditeur Général de Crète, Luca Michiel. La supervision est ensuite assurée par d'importants fonctionnaires Vénitiens, ayant déjà acquéri une grande expérience dans la construction de forteresses dans d'autres régions de Crète et qui donnent aussi leur nom dans des sections et fortifications de la forteresse de Spinalonga.
Comme matériaux de construction sont utilisés la pierre calcaire dure de l'îlot lui-même et le grès tendre (ammouda) extrait du côté est de Spinalonga et de la péninsule adjacente.
Une centaine de personnes de différentes spécialités, une main d'œuvre locale composée de tailleurs de pierre, de maîtres artisans, d'artisans, de maçons et de charpentiers, travaillaient quotidiennement pour construire la forteresse, rémunérés en fonction de leur place dans le processus de production. Des habitants provenant des régions de Sitia et Ierapetra y travaillent également, ainsi accomplissant leur travail obligatoire (corvées), conformément à la réglementation en vigueur à l'époque. Pour l'extraction de la pierre, ils font appel à des experts, même de la région de La Canée, qui avaient travaillé sur la construction de la forteresse de Souda. On taille les pierres, bâtit des fours à chaux et transport de la terre adaptée aux remblais. La terre rouge qui existe aujourd'hui sur l'îlot y a été transportée à cet effet. La marine vénitienne aide avec ces transports.