L'hôpital de la Léproserie fonctionne dans la mosquée ottomane écroulé, qui fut construit à sa tour sur le site de l'église catholique d'Agia Barbara. Dans les années 1930, le bâtiment est agrandi, acquérant un espace d'accueil au sud et des espaces auxiliaires au nord (cuisine, entrepôt, etc.). Le toit en tuiles de la mosquée est enlevé et une dalle en béton armé prend sa place. Les quatre salles de part et d'autre du couloir dans le noyau initial de la mosquée fonctionnent comme des chambres de soins.

Sur sa façade ouest de l'Hôpital est inscrite à la chaux une inscription, visible surtout les jours de pluie : Voici le Calvaire du XXème siècle.