На Спиналонге содержались в основном выходцы из сельских семей с относительно низким уровнем доходов и образования. Они жили в изоляции, вдали от своих родственников, боролись с мучительной болезнью и еле выживали на суровом и засушливом острове. Их образ жизни определялся правилами, установленными Критским, а затем и Греческим государством. С момента изоляции на острове пациенты лишались гражданских прав, теряли свое имущество, а если они состояли в браке, то их брак аннулировался.

Прокаженные селились на нижних уровнях старого поселения, вокруг двух ворот крепости, и образовывали особую социальную группу со своеобразными правилами и ценностями. В первые десятилетия они жили исключительно в уже существовавших на тот момент старых домах, где не имелось даже самых элементарных удобств. Позже, в 1930-е гг., были построены новые здания, и условия жизни значительно улучшились.

С помощью государственного пособия больные стали финансово независимыми и могли покупать основные продукты питания. За центральными воротами раскинулся небольшой базар. Больные спускались туда, чтобы купить различные товары у местных производителей, и через посредничество охранника расплачивались деньгами, которые предварительно проходили дезинфекцию. Все остальное заказывалось в городе Агиос Николаос или можно было приобрести в продуктовых лавках на острове. На острове также было кафе, которое содержали сами прокаженные. Те, у кого были силы, занимались выращиванием овощей и рыболовством.

Каждый прокаженный имел личное жилье и вел свое хозяйство. Говорят, что были матери и жены пациентов, которые следовали за своими родственниками и селились на Спиналонге, чтобы ухаживать за ними. Следует отметить, что священники жили вместе с прокаженными, совершая Божественную литургию и оказывая им помощь. Ведь несмотря на то, что государство запрещало прокаженным жениться, многие из них вступали в брак, в результате чего рождались здоровые дети, которые жили на острове со своими родителями. После 1938 г. в инфекционной больнице Св. Варвары было открыто детское отделение, куда в принудительном порядке были перевезены и поселены «прокаженные» из Спиналонги, где за ними велось медицинское наблюдение до достижения ими совершеннолетия.