Бастион Донато, получивший свое название от имени генерал-капитана, военного губернатора Крита Натала Донато, имеет более простую конструкцию и меньшие размеры чем бастион Тьеполо. Он имеет два фронта — южный и восточный, а его редан, сохранившийся в очень хорошем состоянии, выдается прямо в море. На оконечности редана находится круглая купольная турель. Парапет с бойницами снаружи, со стороны бастиона, а также бойницы на редане рядом со сторожевой башней были обустроены во времена Критской войны. Одновременно были построены две амбразуры открытого типа.

С первых лет существования Лепрозория плац бастиона Донато был превращен в кладбище. Позже, когда места стало уже не хватать, стали разбирать амбразуры открытого типа и обустраивать на их месте цементные гробницы. На северной стороне бастиона Донато был создан небольшой оссуарий.